ググっても「値段が違うけど、それ以上の違いって何？」と思ったので実地調査しました。
以下続きを読むから
これ（文庫版）
と、これ（ジュニア文庫版）
まず、表紙がジュニア版では（入りやすいようにか）劇場アニメ絵が使われていますが、文庫版では一般書籍感する表紙になってます。
次に、文庫版では挿絵などは一切なく、また巻末の他の小説の広告等もありません。 逆に、ジュニア版では挿絵というより劇場アニメ絵が数枚ほど（ホテルのシーンなど）がモノクロで2枚同時に1Pほど挿入されており、巻末に広告が入っています。
また、ルビがジュニア版には振られてます（中学生辺り向けに出版され直されてるやつだから当然ですが）
ただ、ぱっと表紙やら本を手にとって分かる情報をまとめたので、内容の改変などのことまではわからないのであしからず。
あとは、サイズが違うくらいでしょうか。 総じてジュニア版を選ぶ理由はなさそうです。 あえて言うなら表紙でしょうか。
